单位不配合申请工伤认定时，可能遇到以下特殊情况或例外情形：
1. **劳动关系不明确**：若未签劳动合同或事实劳动关系缺乏证据，需先经劳动仲裁确认劳动关系，增加维权复杂度与时间成本。
2. **事故性质存争议**：单位否认工伤时，需提供医疗记录、目击证人证言等详尽证据证明工伤事实，否则影响认定结果。
3. **单位破产或注销**：若用人单位已破产或注销，职工需直接向工伤保险基金申请待遇，但需满足已参保且材料齐全等前提条件。
遇上述问题，建议及时咨询专业律师获取帮助。
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依据《工伤保险条例》第十八条，单位不配合时，职工或其家属可依法自行申请工伤认定。
《工伤保险条例》第十八条明确：“提出工伤认定申请应提交：（一）工伤认定申请表；（二）劳动关系（含事实劳动关系）证明材料；（三）医疗诊断证明或职业病诊断材料。”
该条第二款规定“申请表需含事故时间、地点、原因及伤害程度”，第三款明确“材料不完整的，社保部门应一次性告知补正要求，补正后受理”。
因此，单位不配合时，职工或其直系亲属、工会组织有权自行提交申请，只要材料完整，社保部门应依法受理认定。这为职工提供了明确的法律救济途径。
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单位不配合申请工伤认定时，受伤职工或家属可按以下情况应对：
1. **单位拒不提交申请**：职工本人或近亲属可在事故发生之日起1年内，直接向社保行政部门提出申请。
2. **单位否认劳动关系或工伤事实**：需收集保存劳动合同、工资记录、医疗证明、目击证言等证据，证明劳动关系及工伤事实。
3. **单位拖延或拒绝提供材料**：可向当地劳动监察部门投诉，要求督促单位履行义务。
4. **存在劳动关系争议**：通过劳动仲裁确认劳动关系，为后续认定提供依据。
5. **单位恶意拒绝配合甚至威胁**：向工会组织反映，请求协助维权，必要时可报警。
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单位不配合申请工伤认定可能面临以下法律风险：
1. **诉讼时效风险**：根据《工伤保险条例》，工伤认定申请需在事故发生后1年内提出，若单位拖延导致超期，可能丧失认定资格。例如某员工等待单位申请14个月后，因超期无法认定。
2. **经济损失风险**：未及时认定将影响工伤保险待遇，如医疗费用报销、伤残津贴、一次性伤残补助金等。例如某员工因单位不配合，自费承担数万元医疗费用。
3. **证据链断裂风险**：单位不配合提供劳动关系证明或医疗材料，职工个人难收集完整证据，可能导致认定失败。例如某员工因无劳动合同和工资记录，被拒绝受理工伤认定。
上述风险严重影响职工权益，建议及时采取法律手段应对。

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